瘟疫一直是与人类相伴的。
具有传染性的病毒，在一定程度上塑造了人类历史和当今世界的格局。
比如，黑死病在一定程度导致中世纪的欧洲重新审视上帝，然后有了文艺复兴，开启了新的文明时代。黑死病是蒙古人将鼠疫带到欧洲所致——一种病毒被带到一个陌生的地方，当地人因为没有对这种病毒的免疫力而大片大片地倒下。
比如，欧洲人抵达美洲大陆带去的病毒，将原住民大量杀死。原住民在抵抗为数极少的欧洲人时出现大量的非战争死亡，认为自己遭到了上天的惩罚。美洲原住民对于另一个大陆来的病毒，毫无免疫力。凡是与世隔绝的地方的人，在免疫力上都是脆弱的。
比如，东汉末年出现的三国鼎立，一定程度上也与当时的瘟疫有关。曹操带领大军想要统一全国，赤壁大战的失败与士兵“水土不服”而大量死亡有关。所谓水土不服，就是对当地的病毒缺乏免疫力。曹操的赤壁之败，很大程度上是败给瘟疫。曹操的第一谋士郭嘉在跟曹操聊天的时候曾建议，应该平定南方的荆州，但他同时表示，如果自己也去南方，肯定就不打算活着回来了，“吾往南方，则不生还”。为啥，因为对于北方人对南方的病毒没有抵抗力。纵是曹操有数十万大军，在南方病毒面前，也只能纷纷倒下。军队，几乎是病毒传播的最佳场所。
说到东汉末年，多说几句——东汉末年全国人口从鼎盛时期的五六千万，减少到大概1000万，与饥荒、战争有关，更与瘟疫有关。中国历史上的著名医生张仲景，就是东汉末年的人物，在其所著的研究瘟疫的《伤寒杂病论》的序言里，他说，其宗族有人口约有200人，一场大瘟疫之后，死去了三分之二，其中10个里有7个直接死于瘟疫。
美国历史学者威廉*迈克尼尔所著的《瘟疫与人》一书，堪称一本传染病视角的“人类简史”。由于中国有详细记载历史的传统，这本书专门统计了中国的史书里记载的瘟疫，结果发现，小型瘟疫几乎没有中断过。
当然，中国历史上，类似于东汉末年的那种大瘟疫也是时有发生的。为啥有些时候中国处于割据状态而无法统一，很可能与瘟疫有密切的关系。为啥一个强大的王朝突然崩溃，很可能也与瘟疫有密切的关系。
元朝，无疑是一个强大的王朝。蒙古人的铁蹄横跨欧亚大陆，直接推动了“全球化”。
人类全球化的过程，也是病毒全球化的过程。比如，丝绸之路，就加速了欧亚之间的病毒传播，而航海技术的发展，更是导致了病毒的“大交流”。
人类因为互相交流而互相增进文明，但是病毒的交流则直接带来人口的非正常死亡。因为一个地方的人与本地的病毒早已经达成了平衡，也就是对本地的病毒具有了免疫力，但是对外地人带来的新病毒，则常常无还手之力。
强大的蒙古铁骑横扫欧亚大陆的时候，也就鼠疫这种病毒扩散到全世界的年代，并导致了欧亚大陆人口的剧烈减少。
据推测，鼠疫最早可能是蒙古人入侵中国云南、缅甸一带的时候，将其携带到北方的，然后又被蒙古人带到欧洲。在古代有些地方，当地土著在猎杀某些动物的时候，往往有某种迷信行为，比如有的只能射杀而不能活捉之类的，否则会遭到报应。这种迷信的产生，本质上是因为那样做可以尽量少地感染病毒。入侵者既不懂也不尊重被征服地的习俗或迷信行为，更容易感染当地的病毒。清末东北鼠疫泛滥，据说也与大量内地人闯关东后，不了解当地习俗有关。
还是回到元朝。蒙古人建立了人类历史上最大疆域的汗国，同时加速了亚欧大陆病毒的交流和泛滥。蒙古人带去的鼠疫将欧洲的历史改写，这是有目共睹的。那么，蒙古人在中国地域上锁建立的元朝呢，当然也没有免遭瘟疫。
元朝与欧洲流行的是否是同一种病毒，是有争议的。但可以确定的是，基本上欧洲发生黑死病的相同年代，元朝也有大瘟疫发生。
中国的史书记载的元朝大瘟疫暴发于1331年，并持续了多年。那一年，在今天的河北一带，瘟疫突然杀死了当地9/10的人口。
史书记载，14世纪四五十年代，元朝发生了严重的瘟疫。这些年代，本来就水灾、旱灾和饥荒多重夹击，而瘟疫就更加无情了——饥荒之下，人们还可以逃荒，而瘟疫到来，逃无可逃，往往是一个家庭一个家庭地被灭门。
元朝的掘墓人朱元璋，就是在瘟疫的逼迫之下成为流民，最终加入了农民起义军，红巾军。红巾军之所以佩戴红巾，是因为当时的人们认为红色可以“辟邪”。也就是说，红巾军之名其实与瘟疫相关。
1344年，朱元璋16岁，那一年春夏之交的三个星期内，他失去了父亲、大哥、侄子、母亲4个亲人。朱元璋大伯一家更惨，14个口人被灭了13口。朱元璋的亲人患病的症状是，发高烧，上吐下泻，然后迅速死去。这种症状以及全家人密集地死去，显然是病毒感染所致。
欧洲的黑死病大暴发于1346年，在当时的元朝，草民朱元璋已经埋葬完父母亲人，独自一人流浪，讨饭。
像朱元璋那样遭遇的家庭不在少数，当然，病毒并非只袭击朱元璋这样的平民家庭。
军队中大量的士兵死去。一度，在3个月的时间里，朝廷有16个皇子陆续死去。
元朝在中国的统治不足百年，但皇帝密集地换，其中一个原因就是皇帝频繁地死去。历史上，中国的皇帝一般都不长寿，元朝的皇帝更是“容易死”，到底是宫廷的谋杀太多，还是与瘟疫有关，不得而知。
总之，瘟疫的流行，最终导致朝廷对社会的控制力减弱。那些在瘟疫中幸存下来从死人堆里爬出来的平民们，应该也更容易为了活下去铤而走险。
本来，与后来的明朝相比，元朝对社会的管制是非常宽松的，元朝的赋税也比较轻——这是后来的明朝人的评价。也就是说，元朝本来对社会和人民的控制不那么细致，在瘟疫的打击之下，朝廷的控制力进一步弱化。于是，原本所向披靡的蒙古铁骑，在农民起义的冲击之下，很快无力应对。就这样，元朝社会的大动荡，很快瓦解了这个异族政权。
1368年，在农民军中成长起来的朱元璋，彻底赶走了元朝统治者建立了明朝。可以说，朱元璋家族悲剧是瘟疫造成的，但瘟疫也大大地帮助了朱元璋的“事业”。没有那场大瘟疫，农民起义大概早就被扑灭了。
有人说，明朝的历史是从一个讨饭的碗开始，到一个上吊的绳结束的。前者是指朱元璋的流浪讨饭，后者是指明朝最后一个皇帝朱由检在北京上吊自杀。
事实上，明朝的崩溃也与瘟疫关系极大——这个因为瘟疫而得以建立起来的帝国，最终也是在瘟疫之下崩溃的。
电影《大明劫》里讲述了明末的瘟疫之惨烈。这部电影的宣传海报上写着“末日之战”。当时的中国北方，如同世界末日一般，瘟疫、饥荒、战争肆虐，已经是人间地狱。有资料说，明末的瘟疫大约导致1000万人的非正常死亡。
史书记载，“万历八年，大同瘟疫大作，十室九病，接踵而亡，数口之家，一染此疫，阖门不起”。万历八年即1580年，距离崇祯皇帝上吊自杀还有64年；大同，10个家庭有9个染病，一旦染病，全家倒下。
这只是明末大瘟疫的开始。几乎每年都有瘟疫，只是大小不同罢了。比如1618年，“山西湖南贵州云南均发生瘟疫，其中山西尸横遍野”。1633年，山西再次大暴发鼠疫。1641年，河南河北山西，“处处死尸枕藉”，当年瘟疫传到京师，史书上有四个字“京师大疫”。
以1640年为例，也就是明亡的倒数第5年，如今的河北南部，大名府瘟疫大行，人死十之五六。与大名府临近的河北广平府，“大饥疫，人相食”。瘟疫流行的面积极为广大，河南全省大瘟疫。今天的河南原阳县一带，死者十九，荥阳县一带，“民死不隔户，三月路无人行”。此外，山东，安徽，多地被瘟疫攻陷，很多地方死亡比例达到90%。
整个北方大地被瘟疫覆盖，导致人口大量减少，必然导致朝廷的财政收入减少。而农民军到处劫掠，将剩下的财富掠夺一空。朝廷对中国北方的控制能力和获取财富的能力均被严重削弱，同时又需要投入大量的财力镇压农民军。再加上崇祯皇帝优柔寡断没有逃往相对附属的南方，明朝政权的崩溃，已经是时间问题。
最终，崇祯皇帝朱由检用一根上吊绳结束了当年朱元璋用一个讨饭碗奠基的大明王朝。等到满清八旗兵进入山海关的时候，其实中国北方已经基本上空空荡荡。人口大面积死亡了，病毒也就失去了宿主。于是，满清八旗如入无人之境，让吴三桂在前面开道，迅速占领了半个大明的江山……
一个王朝的覆灭，一个政权的崩溃，原因是多重的，但直接原因都是因为朝廷对社会的控制力大幅削弱。由于古人没有应对病毒的有效方法，因而朝廷在大瘟疫完全是束手无策的，对社会的控制力也就大大削弱——在社会进入“地狱模式”的时候，谁还在乎朝廷的王法？！
纵观古代历史，无论是欧洲还是亚洲，当大瘟疫到来，只能是“坐以待毙”，等待大量人口死亡之后，幸存者产生了免疫力，瘟疫才算过去。
总之，说元朝和明朝亡于瘟疫是有一定道理的，进而可以说，防控瘟疫其实就是防范社会动荡和避免政权崩溃。
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